双轨悬挂喷灌机采用可编程控制器控制喷灌机的运行。双轨悬挂喷灌机速度在1.5m/min~21/m/min范围内可调。根据需要，前进和返回的速度可以分别设置，且在运行过程中左、右喷嘴臂可分别设置为通水或断水状态。

双轨悬挂喷灌机具有内在保护机制，在机器或喷嘴臂遇阻时自动停机。型移动式喷灌机采用微电脑编程控制喷灌机的运行，带液晶显示屏（LCD）的手持悬挂式编程器，利用滚动编程菜单使每个编程参数都在屏幕上显示，并方便的用按键进行编制设定。

通过电子程序控制面板和轨道上粘贴的电子条形码配合使用，可以一次输入50个程序，满足同一座温室种植多种作物时不同作物的灌溉要求。每个灌溉区可以根据独立的灌溉程序自动实施灌溉作业。每个灌溉程序有独立的启动时间、停止时间、重复灌溉时间、灌溉次数、喷灌机运行速度和阀门控制。